為闡明腸道微生物晝夜性節(jié)律變化，作者對小鼠進(jìn)行了研究。讓小鼠暴露于黑暗中12個小時，然后暴露在光線中12個小時，循環(huán)多次。結(jié)果發(fā)現(xiàn)在結(jié)腸細(xì)菌生物地理學(xué)方面出現(xiàn)實(shí)質(zhì)性變化，特別是在光照期間上皮粘液層中的細(xì)菌數(shù)量減少，并且在黑暗期間具有最高的數(shù)量。一些物種（如典型的粘液性細(xì)菌Mucispirillumschaedleri）在上皮粘附方面出現(xiàn)較大的變化。

      此外，宏基因組測序顯示那些涉及到趨化性、鞭毛運(yùn)動和粘液降解的代謝途徑也具有晝夜振蕩的特點(diǎn)。細(xì)菌生物地理學(xué)中的這些變化受到進(jìn)食模式和上皮屏障功能的影響，但不受宿主的分子時鐘的影響。

     為了評估微生物群振蕩對宿主的影響，作者研究了宿主轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組的節(jié)律性。使用抗生素和無菌處理的小鼠在宿主腸道中的轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組的分布發(fā)生顯著變化。出乎意料的是，在微生物耗盡之后，參與代謝平衡的基因和通路重新獲得節(jié)律性，因此作者提出以下假設(shè)：宿主重新獲得振蕩功能以彌補(bǔ)腸道微生物組的缺失?？梢酝ㄟ^克隆無菌小鼠進(jìn)行驗(yàn)證。小鼠含有來自小鼠和大鼠的段絲狀細(xì)菌體建群來證實(shí)。其中，前者表現(xiàn)出鼠腸上皮的粘附性獲得強(qiáng)化。只有表現(xiàn)出節(jié)律性上皮組織粘附的細(xì)菌才能夠影響轉(zhuǎn)錄宿主振蕩的編程。

     總之，這項(xiàng)研究可以讓我們深入地了解到腸道微生物組在晝夜生理學(xué)以及外周器官轉(zhuǎn)錄活性調(diào)節(jié)中的作用，可以為治療與晝夜節(jié)律時鐘功能障礙相關(guān)的人類疾病提供新的思路。